Sejak didirikan, SMK Perikanan dan Kelautan Puger Jember, telah berkomitmen menjadi sekolah yang mengutamakan pendidikan karakter kepada seluruh warga terutama siswa-siswinya (selanjutnya disebut taruna-taruni). SMK Perikanan dan Kelautan Puger Jember menerapkan pendidikan semi militer. Model pendidikan ini bukan dimaksudkan untuk menanamkan kekerasan, tetapi untuk menanamkan nilai-nilai pendidikan karakter. Misalnya keharusan berpakaian dan berpenampilan rapi, keharusan untuk disiplin dan tepat waktu di setiap kegiatan di sekolah, dan sebagainya.